Налоговые вычеты применяются к месторождениям Татарстана и Башкортостана, установлены понижающие коэффициенты для месторождений с извлекаемыми запасами менее 5 млн т, трудноизвлекаемыми запасами и месторождений с высокой степенью выработанности. Льготные ставки экспортной пошлины к морским месторождениям действуют до достижения значения внутренней нормы рентабельности 16,3%, планируются к установлению адвалорные ставки (в процентах от стоимости) в отношении континентального шельфа. Таким образом, по словам Дениса Храмова, в настоящее время более 800 месторождений нефти в России подпадает под льготы. В целом по минеральному сырью сумма льгот достигает 13% от всей суммы собираемого НДПИ (323 млрд рублей).

Минприроды также отмечает целый ряд факторов неэффективного освоения имеющегося в стране инвестиционного потенциала, среди которых недостаточная геологическая изученность российского шельфа, естественное снижение размера открываемых месторождений, ухудшение качества и снижение концентраций полезных ископаемых в рудах, перемещение центров геологоразведки и добычи в труднодоступные районы с неразвитой инфраструктурой. Для стимулирования ГРР министерство предлагает ввести вычеты затрат на геологоразведку из суммы НДПИ, что должно обеспечить необходимый уровень рентабельности разработки месторождения с учётом инвестиций на геологоразведочные работы.