Станция работает с расходами воды  28,2 тысячи м³/с. Уровень воды в верхнем бьефе в соответствии с указанием Федерального агентства водных ресурсов (Росводресурсов) находится на отметке 28 метров, уровень воды в нижнем бьефе – 20,8 м.

Куйбышевское водохранилище является основным регулятором стока Волги и играет особую роль в обеспечении весеннего пропуска воды в низовья Волги. От работы этой гидростанции зависит развитие половодья на расположенных ниже волжских ГЭС. Ход половодья-2018 на сегодняшний день можно назвать спокойным. «Однако погодные условия еще могут внести коррективы», - отметил директор Жигулевской ГЭС Олег Леонов. 

Открытие первых затворов Саратовской ГЭС для пропуска паводковой воды состоялось на 15 апреля, пиковых сбросов станция достигла к 23 апреля, в настоящий момент в работе находятся 20 гидроагрегатов, задействованы 40 водосбросов. Все волжские ГЭС работают с максимальными расходами воды – и так будет продолжаться до 30 апреля, до тех пор, пока Росводресурсы не установят новые режимы.

Саратовское водохранилище - особое. В нем отсутствует аккумулирующая ёмкость: вся поступающая вода транзитом проходит через Саратовский гидроузел в Волгоградское водохранилище. Саратовское водохранилище расположено выше гидросооружений Саратовской ГЭС - на территории Саратовской, Самарской и Ульяновской областей.  Ниже сооружений Саратовской ГЭС находится Волгоградское водохранилище (многие города и районы Саратовской области, в т.ч. Саратов, Энгельс, Вольск, Маркс расположены по берегам именно Волгоградского водохранилища).

Самым многоводным был паводок в 1979 году: был зафиксирован максимальный расход воды – 39,21 тысяч м³/с, при этом уровень воды в нижнем бьефе достиг отметки 23,17 м (на 2 метра выше нынешнего уровня). В 2015 году зафиксирован минимальный  расход воды – 18,1 тысяч м³/с , при этом уровень воды в нижнем бьефе достиг отметки 18,46 м. В  среднем половодье длится 40-50 дней. Рекордно коротким был паводок в 1975 году – он длился всего 9 дней. Рекорд по самому продолжительному половодью установлен в прошлом году – паводок-2017 продолжался 108 дней.